目前普通的養(yǎng)殖技術都是基于自然或傳統(tǒng)養(yǎng)殖模式條件下魚類的生理活動研究成果，但是在工廠化高密度條件下，魚類受到環(huán)境脅迫，生理狀況會有顯著變化，水生態(tài)環(huán)境更為單一，養(yǎng)殖技術應有相應的調整。我國目前在該領域的研究嚴重滯后于生產，無法提供成熟的養(yǎng)殖工藝，設施的效能不能得到發(fā)揮。部分配套技術的發(fā)展也不均衡，比如飼料品質普遍較差，營養(yǎng)轉移效率低且不穩(wěn)定，增加了設施系統(tǒng)的處理負荷，導致綜合效益下降。因此，需要針對工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖的系統(tǒng)條件，研究發(fā)展配套的養(yǎng)殖技術。

在藻類生長所需的大量元素中，磷、氮通常是水體浮游植物增長的限制性因子，總氮大于1.2毫克/升、總磷大于0.11毫克/升時水體開始富營養(yǎng)化，在淡水中當總磷小于0.1毫克/升時藻類生長發(fā)展為磷限制。而過高的磷輸入如總磷為1.65毫克/升，并不能促進藻類生長。要培養(yǎng)出養(yǎng)殖所需要的有益藻、抑制藍藻、裸藻等有害藻，我們需要重點關注一些化學指標，總堿度、硬度、鹽度、氮、磷、碳以及微量元素鈣、鐵、錳、鋅等有可能成為限制性因子的指標。池塘中的有機質含量可通過檢測水中有機耗氧量得知，水中有機質含量高，氮磷的含量也會高，在降氨氮同時可以降低水體有機質含量。

工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)是以工業(yè)化手段主動控制水環(huán)境，水資源消耗小、占地少、對環(huán)境污染小、產品優(yōu)質安全、病害少、密度高、養(yǎng)殖生產不受地域或氣候的限制和影響，資源利用率高，是高投入高產出，低風險實現水產養(yǎng)殖業(yè)可持續(xù)發(fā)展的重要途徑。工廠化循環(huán)水養(yǎng)殖采取集約化生產方式，減少了人力成本，降低了餌料系數。10%的養(yǎng)殖面積產出百分百的產量，這僅僅是其優(yōu)勢之一，更加環(huán)保的養(yǎng)殖方式，也提高了養(yǎng)殖品種的品質，可以獲得更好的產品售價和經濟效益。消費者對高品質的水產品需求日益增長，傳統(tǒng)養(yǎng)殖方式產出的水產品沒有太多的附加值空間，利潤小，風險高，已經很難適應高端消費者的需求。