１６ＳｒＲＮＡ 序列

分析技術(shù)的基本原理就是利用恒定區(qū)序列設(shè)計通用引物從微

生物樣本中擴增出１６ＳｒＲＮＡ 的 基 因 片 段，通 過 克 隆 測 序、探

針雜交、酶切片段多態(tài)性分析或凝膠電泳等方 法獲 得 １６Ｓ

ｒＲＮＡ 序列信息，再與１６ＳｒＲＮＡ 基因數(shù)據(jù)庫中的序列數(shù)據(jù)或

其他數(shù)據(jù)進行同源對比及分析，從而鑒定樣本中可能存在的病

原菌種類。目前絕大多數(shù)的研究都 是 先 將１６ＳｒＲＮＡ 反 轉(zhuǎn) 錄 為１６ＳｒＤＮＡ 再 進 行 進 一 步

的研究。也可以提取細(xì)菌總的 ＤＮＡ 之 后，利用細(xì)菌通用引物

對樣品總 ＤＮＡ 中的１６ＳｒＲＮＡ 基因進行全長擴增，再對 ＰＣＲ

產(chǎn)物進行進一步研究。 您喜歡16s 的這些特點嗎？重慶真核微生物16S測序公司哪里有

傳統(tǒng)的微生物鑒定方法，主要通過將微生物培養(yǎng)后依據(jù)形態(tài)學(xué)、生理生化反應(yīng)、生態(tài)學(xué)特征等進行鑒別。 Orji 等指出這種方法只能檢測出約 1%的重要病原菌，而利用宏基因組學(xué)、高通量測序、系統(tǒng)發(fā)育樹分析等

技術(shù)，自然界中 的致病菌都能得到研究。隨著基因測序技術(shù)的發(fā)展，16S rDNA 擴增子測序技術(shù)的應(yīng)用

越來越，已成為研究大氣、水、油井等環(huán)境樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的重要手段。采用高通量測序技術(shù)對樣本 １６Ｓ ｒＤＮＡ 片段進行測序，可以獲得準(zhǔn)確的序列信息和更大的數(shù)據(jù)量，從而 在后續(xù)分析中獲得更加深入、和可靠的結(jié)果。 重慶真核微生物16S測序公司哪里有16s 18S ITS 多種測序供您選擇。

在過去的十幾年中，下一代測序(NGS)技術(shù)被

用于探索各種生態(tài)系統(tǒng)中微生物群落的多樣

性和組成結(jié)構(gòu)，對研究海洋、土壤、宿主等環(huán)境中

的微生物構(gòu)成有重要的指導(dǎo)作用，同時也是系統(tǒng)發(fā)

育和分類學(xué)研究中一種使用的方法，特別是應(yīng)

用于不同的環(huán)境宏基因組學(xué)樣本中。隨著高通量

測序技術(shù)的不斷發(fā)展和參考數(shù)據(jù)庫的不斷更新，利

用核糖體操縱子作為 DNA 標(biāo)記可以揭示不同生態(tài)

系統(tǒng)中的微生物多樣性和組成。采用第二代高通量

測序平臺測定的16S/18S/ITS某個高變區(qū)域的序列，

可以反映環(huán)境樣品在細(xì)菌、、古菌等分類方面

物種之間的差異。然而，針對不同的環(huán)境樣本，引

物的選擇和實驗過程仍然需要更細(xì)致的驗證。

16S rRNA 基因直接測序法：對微生物 16S rRNA 基因進行測序時比較好進 行全長測序, 尤其是所測序列將要用于探針設(shè)計 和新物種確定時。另外, 采用正反向引物對所測序 列進行重復(fù)驗證可以確保序列的準(zhǔn)確性。但由于 目前測序費用還比較高昂, 因此許多研究者也采 用測 16S rRNA 基因部分序列的方法進行微生物 多樣性分析和平行樣品比較。研究表明, 400~600 堿基的序列足以對環(huán)境中微生物的多樣性和種群 分類進行初步的估計, 但這樣短的序列通常不能 用于新物種鑒定和探針設(shè)計。上海融享生物科技有限公司測序的16s 很好。

用下一代測序技術(shù)(next generation sequencing，NGS)測定

16S/18S/ITS 某個可變區(qū)的序列，可以反映環(huán)境樣

品在細(xì)菌、、古菌等組成的微生物群落之間的

差異，對研究海洋、土壤、宿主等不同環(huán)境中的

微生物群落組成及動態(tài)變化有重要的指導(dǎo)作用，同

時也是系統(tǒng)發(fā)育和分類學(xué)研究中一種使用的方法。

顯，能夠反映出種屬間甚至菌株間的差異。此外，

ITS 序列片段較小(ITS1 和 ITS2 長度分別為 350 bp

和 400 bp 左右，但不同物種之間存在一定差異)，

易于分析。也就是說，ITS 具有更高的擴增和測序

成功率以及分類學(xué)分辨率，目前已被應(yīng)用于真

菌不同種屬的系統(tǒng)發(fā)育分析。 16s 的各種測序應(yīng)用領(lǐng)域還是不一樣的。重慶真核微生物16S測序公司哪里有

ITS 的多種測序總有一款是您滿意。重慶真核微生物16S測序公司哪里有

2000 年, M Manzano 等利用溫度梯度凝膠電泳的方法 分析 16S rRNA 對分離自食物中的利斯特氏菌進行了鑒定。 2001 年, HJ Monstein 等利用溫度梯度凝膠 電泳和 PCR 擴增 16S rRNA 的 V6 區(qū) ( 可變區(qū)) 片段的方法對 16 株腸球菌進行了鑒定。2001 年, 沈永才等利用 16S rRNA 的 PCR 法鑒定了 8 株 雙歧桿菌, 并用 16S rRNA 熒光定量 PCR 法對雙 歧桿菌進行了定量檢測。2002 年, A Manero 等對 利用 16S rRNA 探針雜交的方法鑒定腸球菌屬細(xì) 菌進行綜述。2002 年, Y Woo- PatrickC 等通過 16S rRNA 序列分析的方法, 從一位菌血癥膽囊 炎患者體內(nèi)檢測到了唾液乳桿菌的存在。2003 年, Y Seto 等對 16S rRNA 序列特定長度片段進 行 分 析 , 對 人 體 糞 便 樣 品 中 嗜 酸 乳 桿 菌 ( Lactobacillus acidophilus) 的分布情況進行了檢 測。2003 年, JR Byun 等利用分析 16S rRNA 和 23S rRNA 間區(qū)序列的方法對一株鼠李糖乳桿菌 ( Lactobacillus rhamnosus ATCC 53103) 進行了鑒 定, 并與干酪乳桿菌( L. casei) 、嗜酸乳桿菌( L. acidophilus) 和瑞氏乳桿菌( L. helveticus) 的 16S rRNA 和 23S rRNA 間區(qū)片段進行了比較。重慶真核微生物16S測序公司哪里有