負(fù)對(duì)照有信號(hào)引物設(shè)計(jì)不夠優(yōu)化:應(yīng)避免引物二聚體和發(fā)夾結(jié)構(gòu)的出現(xiàn)。引物濃度不佳:適當(dāng)降低引物的濃度,并注意上下游引物的濃度配比。鎂離子濃度過高:適當(dāng)降低鎂離子濃度,或選擇更合適的mix試劑盒。模板有基因組的污染:RNA提取過程中避免基因組DNA的引入,或通過引物設(shè)計(jì)避免非特異擴(kuò)增。擴(kuò)增效率低反應(yīng)試劑中部分成分特別是熒光染料降解。反應(yīng)條件不夠優(yōu)化:可適當(dāng)降低退火溫度或改為三步擴(kuò)增法。反應(yīng)體系中有PCR反應(yīng)抑制物:一般是加入模板時(shí)所引入,應(yīng)先把模板適度稀釋,再加入反應(yīng)體系中,減少抑制物的影響。SYBRGreen法qPCR機(jī)構(gòu)哪家靠譜?河南相對(duì)定量qPCR服務(wù)
Real-time PCR 中引物設(shè)計(jì)的好壞常常關(guān)系到整 個(gè)實(shí)驗(yàn)的成敗。引物設(shè)計(jì)過程中,除了避免非特異性、 無引物二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)及錯(cuò)配外,引物濃度及反 應(yīng)體系也是影響是否產(chǎn)生非特異性擴(kuò)增及擴(kuò)增效率高 低的因素。引物濃度太高,或引物質(zhì)量不高,則易引起 引物二聚體的產(chǎn)生; 引物濃度太低,則可能導(dǎo)致擴(kuò)增效 率下降,終儀器所記錄的熒光信號(hào)不能真實(shí)地反映 基因表達(dá)水平。所以應(yīng)在確保擴(kuò)增效率,盡力避免引 物二聚體的前提下,以出現(xiàn)小 Ct 值和比較高熒光值以 及不出現(xiàn)非特異的擴(kuò)增產(chǎn)物為標(biāo)準(zhǔn),分別對(duì)模板濃度、 退火溫度和引物濃度進(jìn)行優(yōu)化。寧夏實(shí)時(shí)熒光qPCR機(jī)構(gòu)哪家好SYBR熒光染料qPCR實(shí)驗(yàn)就找上海融享生物科技有限公司。
1、SYBRGreen在高濃度情況下會(huì)抑制PCR反應(yīng),但普通的qPCR2×Mix是不會(huì)出現(xiàn)這樣的情況;2、蛋白的檢測(cè)確實(shí)可以說明表達(dá)的問題,泛素化、磷酸化也能檢測(cè)蛋白的作用,其實(shí)檢測(cè)mRNA也能解決大部分的表達(dá)問題,蛋白表達(dá)一般是在mRNA表達(dá)差異不明顯的情況下再使用的;3、芯片是高大上的,但單基因變化,完全用不上基因芯片,而且在做基因芯片之前,也需要在有表達(dá)差異的細(xì)胞或者組織間進(jìn)行;4、二代測(cè)序是更高大上的技術(shù),深度測(cè)序可以了解低頻的突變,轉(zhuǎn)錄本的測(cè)序可以了解細(xì)胞組織的整體的表達(dá)情況,要是你只是檢測(cè)單基因完全沒必要搞得那么復(fù)雜;5、當(dāng)實(shí)驗(yàn)室的師兄,特別是表面上很有科研能力的師兄慫恿你用新技術(shù)的時(shí)候,請(qǐng)千萬要三思而行,自己思考一下才會(huì)省去很多不必要的麻煩;6、記得給老板省點(diǎn)錢,不然小伙伴們不好交差,倘諾自己是老板的小伙伴,自己的經(jīng)費(fèi)更要省著花才對(duì)。
實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 技術(shù)的分類:DNA 染料法:用于實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 的 DNA 染料有 SYBR Green I、
SYBR Gold、EvaGreeEB 與 EB。SYBR Green I 是 目 前 試 驗(yàn) 過
程中常用的一種,該染料結(jié)合于雙鏈 DNA 的小溝處[11],游
離的染料分子只發(fā)出微弱的熒光,錨定到雙鏈 DNA 上的染
料才會(huì)發(fā)出強(qiáng)熒光。在 PCR 延 伸 階 段,SYBR Green I 染 料
結(jié) 合上去,發(fā)出熒光,雙鏈合成越多,熒光強(qiáng)度越強(qiáng)。SYBR
Green I 與 DNA 的結(jié)合具有非特異性,除了與目的片段結(jié)合
外,還能與其他非目的片段的雙鏈 DNA 分子結(jié)合,如非特
異性擴(kuò)增產(chǎn)物、引物二聚體。為了檢測(cè)產(chǎn)物中是否含有非特
異或引物二聚體,在 PCR 反應(yīng)結(jié)束后進(jìn)行一個(gè)溶解曲線分
析,即溫度從 50 ℃升高到 95 ℃,監(jiān)測(cè)這一過程中熒光信號(hào)
的變化情況,用熒光信號(hào)變化的速度與溫度作圖,形成溶解
曲線,若未形成非特異或引物二聚體,特征峰只有 1 個(gè),且
相同基因形成特征峰的 Tm 值相同;若有非特異或引物二
聚 體 時(shí),就會(huì)出現(xiàn)特征峰之外的雜峰。由 于 染 料 法 對(duì) 雙 鏈
DNA 的識(shí)別不具有特異性,所以試驗(yàn)過程中需要合理地設(shè)
計(jì)引物。 上海TaqMan熒光探針qPCR公司哪家靠譜?
1.1實(shí)時(shí)定量PCR的簡寫建議實(shí)時(shí)定量PCR(quantitativereal-timePCR)應(yīng)當(dāng)簡寫為qPCR,反轉(zhuǎn)錄PCR(reversetranscription–qPCR)應(yīng)當(dāng)簡寫為RT-qPCR。用RT-PCR簡寫表示qPCR可以引起混亂,并且與傳統(tǒng)RT-PCR的平常應(yīng)用不符。1.2內(nèi)參基因內(nèi)參基因應(yīng)當(dāng)指的是參照基因(referencegenes),而不是管家基因(housekeepinggenes)。1.3TaqMan探針TaqMan探針應(yīng)指的是水解探針(hydrolysisprobes)。1.4FRETprobeFRETprobe(fluorescenceresonanceenergytransferprobe,熒光共振能量轉(zhuǎn)移探針)指的是一種機(jī)制,基于2個(gè)熒光基團(tuán)的電子激發(fā)狀態(tài)之間的相互作用的基礎(chǔ)上的發(fā)光/淬火。LightCycler型探針指的是雙雜交探針(dualhybridizationprobes)。1.5定量quantification牛津英語詞典只列出了定量(quantification),非定量(non-quantification),因quantification是恰當(dāng)?shù)摹?span style="display:none;">上海融享生物科技有限公司主做的qPCR。河北SYBRGreen法qPCR機(jī)構(gòu)哪里有
qPCR的特點(diǎn)成為了一個(gè)重要因素。河南相對(duì)定量qPCR服務(wù)
其實(shí)沒有一項(xiàng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)是 so easy 的,即便是看起來毫無難度的 qPCR 。但同樣地,任何一項(xiàng)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)都是有套路的,包括 qPCR ,就看你套路深不深。對(duì)于像病毒載量這樣的定量實(shí)驗(yàn)來講,標(biāo)準(zhǔn)曲線的質(zhì)量起到?jīng)Q定性作用。R2值太低一般是由于稀釋操作不夠準(zhǔn)確,或者加樣操作誤差太大;E值太低則可能是由于探針引物設(shè)計(jì)不夠好,或者Ta值不合適;而E值太高則提示可能出現(xiàn)了非特異擴(kuò)增或者PCR擴(kuò)增受抑制的情況。根據(jù)qPCR的MIQE準(zhǔn)則,合適的擴(kuò)增效率E在95%~105%,這就是努力的方向。很多人會(huì)有疑問,為啥要千方百計(jì)的優(yōu)化擴(kuò)增效率呢?擴(kuò)增效率的提高可以提升qPCR檢測(cè)體系的靈敏度、動(dòng)態(tài)范圍,減少非特異性產(chǎn)物的產(chǎn)生;數(shù)據(jù)的重復(fù)性及可信度也會(huì)得到提高;Tm值優(yōu)化是提高擴(kuò)增效率特別直接特別簡單的方法,只需要一臺(tái)具有溫度梯度功能的qPCR設(shè)備即可,時(shí)間上還用不了半天。河南相對(duì)定量qPCR服務(wù)