１６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 基因間區(qū)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)及序列分析的基本

原理 １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 區(qū) 間ＩＳＲ 是 位 于 １６ＳｒＲＮＡ 基 因 與

２３ＳｒＲＮＡ 基因之間的 區(qū) 間 序 列，不僅序列長(zhǎng)度存在差異，而

且序列中間有ｔＲＮＡ 的插入、缺失、突變等特征。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)，

大多數(shù) 革 蘭 陽(yáng) 性 菌 含 有ｔＲＮＡａｌａ、ｔＲＮＡｉｌｅ，少 部 分 只 含 ｔＲ－

ＮＡｇｌｕ基因。相比而言，大部分革蘭陰性菌不含ｔＲＮＡ 基 因，

少部分只含ｔＲＮＡａｌａ或ｔＲＮＡｉｌｅ，或者兩者兼有。另外不同的

細(xì)菌可能含有不同的ｒＲＮＡ 操 縱 子 數(shù) 目。所有這些序列長(zhǎng)度

差異和ｔＲＮＡ 基因數(shù)目的變異為微生物菌的鑒定分型提供了

依據(jù)。研 究 證 實(shí) １６Ｓ～２３ＳｒＲＮＡ 區(qū) 間 的 進(jìn) 化 率 要 高 于 １６Ｓ

ｒＲＮＡ 基因１０ 倍，它 比 １６ＳｒＲＮＡ 有更多的變異區(qū)。 上海融享生物科技有限公司主營(yíng)測(cè)序包括16s 18S ITS 。貴州16S測(cè)序公司哪家好

存在自然界中的微生物多如恒河沙數(shù)，且其中絕大多數(shù)無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行培養(yǎng)觀察。目前所知道的微生物種數(shù)已超過(guò)了十萬(wàn)種，這還是一個(gè)正在急劇擴(kuò)大著的數(shù)字。DNA測(cè)序鑒定方法已經(jīng)被證明比傳統(tǒng)的生化分型和表型分型方法更加準(zhǔn)確、快捷，不依賴菌種本身特點(diǎn)，對(duì)所有菌種均可使用。晶能憑借先進(jìn)的測(cè)序儀器和多年的微生物檢測(cè)經(jīng)驗(yàn)，為您可提供快速、高效、**的微生物檢測(cè)服務(wù)，包括細(xì)菌16S rDNA測(cè)序、18S rDNA測(cè)序、ITS測(cè)序。 rDNA測(cè)序 — 作為一種應(yīng)用于環(huán)境微生物菌落多樣性研究的靶標(biāo)基因測(cè)序技術(shù)，通過(guò)針對(duì)覆蓋16SrDNA的1個(gè)或多個(gè)連續(xù)可變性區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增測(cè)序來(lái)鑒定樣本微生物菌落成員和分析比較多樣本微生物菌落的結(jié)構(gòu)，Illumina的Hiseq2500和MiSeq平臺(tái)可以針對(duì)16S rDNA的1個(gè)區(qū)域進(jìn)行測(cè)序, 具有對(duì)樣本更高的測(cè)序深度、鑒定更多的低豐度群落成員且以較低的費(fèi)用的優(yōu)勢(shì)完成科研項(xiàng)目。河南環(huán)境微生物16S測(cè)序公司哪家好上海融享生物科技有限公司主營(yíng)測(cè)序包括16s 18S ITS 價(jià)格優(yōu)惠。

16SrRNA能夠鑒定難 于分類的微生物種類，鑒定培養(yǎng)陰性的細(xì)菌，細(xì)菌種屬的檢測(cè)。 采用16SrRNA法對(duì)微生物分離鑒定時(shí)要注意防止核酸污染出現(xiàn)假 陽(yáng)性，在檢驗(yàn)標(biāo)本時(shí)控制細(xì)菌的污染。提取的微生物中總DNA能 夠遺傳的多樣性，選擇合適的方法提取樣品中的各種微生物 的基因。避免在探針雜交中出現(xiàn)假陰性結(jié)果，為確定雜交反應(yīng)的 敏感性，所以使用微生物的通用探針作為陽(yáng)性對(duì)照，對(duì)PCR產(chǎn)物中的嵌合序列進(jìn)行排除。隨著現(xiàn)物信息學(xué)的發(fā)展以及大量微 生物的l6SrRNA基因測(cè)序工作的完成，16SrRNA在醫(yī)學(xué)微生物鑒 定中的應(yīng)用越來(lái)越重要。

擴(kuò)增子測(cè)序是對(duì)特定長(zhǎng)度的 PCR 產(chǎn)物或捕獲的片段進(jìn)行測(cè)序，分析序列中的變異。16S/18S/ITS 等擴(kuò)增子測(cè)序即通過(guò)提取環(huán)境樣品的 DNA，選擇合適的通用引物擴(kuò)增 16S/18S/ITS 的目標(biāo)區(qū)域，通過(guò)檢測(cè)目標(biāo)區(qū)域的序列變異和豐度，以研究環(huán)境微生物多樣性及群落組成差異。 技術(shù)優(yōu)勢(shì)： 通量高，適用于大量樣本的特定基因組區(qū)域研究； 周期短，可縮短研究周期，加速臨床應(yīng)用及文章發(fā)表； 信息度高，針對(duì)感興趣的基因組區(qū)域進(jìn)行遺傳變異位點(diǎn)的尋找，可對(duì)特定區(qū)域進(jìn)行深入研究。

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原核生物(細(xì)菌、古菌) rRNA 按核酸的沉降系

數(shù)分為 3 種，分別為 5S、16S 和 23S。16S rRNA 是

核糖體 RNA 的一個(gè)亞基，16S rRNA 基因就是編碼

該亞基的基因。其存在于所有細(xì)菌染色體基因組

中，參與生物蛋白質(zhì)的合成過(guò)程，并在生物進(jìn)化的

漫長(zhǎng)歷程中保持一定的遺傳保守性，是細(xì)菌系統(tǒng)分

類研究中有用和常用的分子標(biāo)記。16S rRNA

基因分子大小適中(長(zhǎng)度約為 1540 bp)，在結(jié)構(gòu)與功

能上又具有高度的保守性，檢測(cè)方便并且與原核生

物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)聯(lián)密切，因此逐漸成為常用的原

核生物標(biāo)記基因。16S rRNA 編碼基因序列共有

9 個(gè)保守區(qū)和 9 個(gè)高可變區(qū)，其中 V4?V6 區(qū)

數(shù)據(jù)庫(kù)信息全、特異性好，是細(xì)菌多樣性分析的常

用目標(biāo)區(qū)域。

18S 的不同測(cè)序會(huì)有不同的優(yōu)勢(shì)。貴州16S測(cè)序公司哪家好

ITS 多種測(cè)序供您選擇。貴州16S測(cè)序公司哪家好

1. 16SrDNA為編碼原核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列，具有10個(gè)保守區(qū)域和9個(gè)高變區(qū)域，其中保守區(qū)在細(xì)菌中差異不大，高變區(qū)具有屬和種的特異性，對(duì)16SrDNA某個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中細(xì)菌或古菌的群落多樣性。18SrDNA測(cè)序：18SrDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列，對(duì)18SrDNA某個(gè)高變區(qū)進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中真核微生物的群落多樣性。ITS測(cè)序：ITS分為兩個(gè)區(qū)域ITS1h和ITS2，ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間，ITS2位于真核生物rDNA序列5.8S和28S之間。對(duì)ITS1或ITS2進(jìn)行測(cè)序，用于研究環(huán)境微生物中群落結(jié)構(gòu)多樣性。

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