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吉林蛋白組學(xué)技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-06-24

綜上所述,本研究應(yīng)用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)合iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),探討油茶種子不同成熟期儲(chǔ)量積累的動(dòng)態(tài)變化。此外,作者還探討了黃酮類(lèi)化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機(jī)制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化,其中317個(gè)DAPs被轉(zhuǎn)錄組結(jié)果覆蓋。結(jié)合結(jié)構(gòu)基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)譜及相應(yīng)化合物的含量,對(duì)重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了探討。結(jié)果表明,黃酮類(lèi)化合物的合成能力在種子成熟過(guò)程中逐漸減弱,而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測(cè),鑒定,定性,定量。吉林蛋白組學(xué)技術(shù)

運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、PRM蛋白靶向驗(yàn)證由鹿明生物提供技術(shù)支持:2021年12月,上海交通大學(xué)張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果,通過(guò)TMT標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)和平行反應(yīng)監(jiān)測(cè)蛋白靶向驗(yàn)證(PRM)技術(shù)研究方法,構(gòu)建了蓮花胚胎脫水保護(hù)的生理調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為揭示荷花種子長(zhǎng)壽的脫水保護(hù)機(jī)制提供了新的見(jiàn)解。吉林蛋白組學(xué)技術(shù)蛋白質(zhì)組學(xué),Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。

蛋白質(zhì)是生命活動(dòng)的主要執(zhí)行者,而蛋白質(zhì)磷酸化修飾是生物體內(nèi)**重要的共價(jià)修飾方式之一,真核生物體內(nèi)有超過(guò)三分之一的蛋白可以發(fā)生磷酸化修飾。蛋白質(zhì)的磷酸化和去磷酸化這一可逆過(guò)程調(diào)節(jié)著包括細(xì)胞增殖、發(fā)育、分化、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞凋亡、神經(jīng)活動(dòng)、肌肉收縮及**發(fā)生等過(guò)程在內(nèi)的所有生命活動(dòng)。單一的磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)只能解釋蛋白磷酸化水平發(fā)生的變化,而[黃金搭檔]——蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組聯(lián)合分析,則在揭示疾病相關(guān)特性、篩選疾病生物標(biāo)志物、尋找藥物靶點(diǎn)等方面發(fā)揮了更加重要的作用。

采用RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析和DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析,研究了AC和AL對(duì)db/db小鼠的影響。轉(zhuǎn)錄組分析共鑒定出16812種不同的蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄本。其中,2837個(gè)(約16.9%)在正常組和對(duì)照組之間有***差異,表明db/db小鼠在轉(zhuǎn)錄水平上與野生型小鼠***不同。與對(duì)照組相比,共有3749個(gè)基因因攝入AC而發(fā)生***改變(2201個(gè)下調(diào),1548個(gè)上調(diào)),560個(gè)基因(430個(gè)下調(diào),130個(gè)上調(diào))因攝入AL而發(fā)生***改變(圖3B)。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析鑒定出2729種蛋白質(zhì)。正常組和對(duì)照組之間共發(fā)現(xiàn)1059個(gè)(約占總鑒定蛋白質(zhì)的38.8%)DEPs,AC處理有230個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(109個(gè)上調(diào),121個(gè)下調(diào)),AL處理有211個(gè)蛋白質(zhì)發(fā)生***變化(116個(gè)上調(diào),95個(gè)下調(diào))。蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤(pán)點(diǎn)。

蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來(lái)自9,832個(gè)磷酸化蛋白的62,879個(gè)磷酸化位點(diǎn)?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個(gè)***改變的**驅(qū)動(dòng)基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊(duì)列相比,本文隊(duì)列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊(duì)列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過(guò)比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學(xué)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復(fù)和細(xì)胞周期通路的上調(diào)以及細(xì)胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進(jìn)一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(guān)(圖1F和1G)。蛋白組學(xué)—精選文章推薦。北京蛋白組學(xué)

蛋白組學(xué),研究方法,高通量定性定量研究,有。吉林蛋白組學(xué)技術(shù)

中文標(biāo)題:肉桂酸和肉桂醛改善肝葡萄糖脂代謝的機(jī)制:多組學(xué)提供的見(jiàn)解研究對(duì)象:小鼠發(fā)表期刊:FrontiersinNutrition影響因子:6.576發(fā)表時(shí)間:2022年1月11日合作單位:北京中醫(yī)藥大學(xué)健康培養(yǎng)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京中醫(yī)藥大學(xué)健康栽培北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京中醫(yī)藥大學(xué)科學(xué)技術(shù)系運(yùn)用組學(xué)關(guān)鍵技術(shù):轉(zhuǎn)錄組學(xué)、DIA蛋白組學(xué)、PRM靶向蛋白驗(yàn)證(皆由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)。目前,改善飲食被認(rèn)為是**安全有效的***和預(yù)防代謝性疾病的方法,其中肉桂(主要是肉桂屬植物八角肉桂和桂皮)及其成分被證明具有多種***作用,包括抗糖尿病、減輕體重、低脂血癥和增強(qiáng)胰島素敏感性。因此,使用膳食補(bǔ)充劑和來(lái)自肉桂的化學(xué)物質(zhì)來(lái)控制血糖和血脂可能成為***代謝類(lèi)疾病的新方法。吉林蛋白組學(xué)技術(shù)

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