作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質。中文標題：氮調節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成：多組學分析揭示的蛋白質水平調節(jié)研究對象：茶樹根發(fā)表期刊：JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子：5.279發(fā)表時間：2021年9月1日發(fā)表單位：安徽農業(yè)大學運用生物技術：TMT蛋白質組學、泛素化蛋白質組學(其中部分數據分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝，通過蛋白質組和泛素化蛋白質組結合轉錄組數據探索了調節(jié)機制。本文的多組學數據整合分析思路值得借鑒。歐易生物鹿明生物蛋白組學聯合分析。遼寧口腔蛋白組學
文章使用TMT標記定量蛋白質組學的方法，分析鑒定了差異表達的蛋白質，對下調的蛋白質進行基因本體論(GO)分析，顯示下調參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM介導的銅依賴性線粒體復合物IV失活是SOX2/OCT4+群體中的主要代謝缺陷。研究結果確定了銅-代謝-轉移軸，并強調了其作為高危TNBC患者的下一代治療方法的潛力。蛋白質組學分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶，是線粒體ETC的終末酶。浙江蛋白組學和代謝組學蛋白質組學技術簡介及應用場景。
作者進行了綜合分析，將蛋白組學和代謝組學中的***生物標志物合并到通路分析中，并確定了半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸鹽相互轉化、檸檬酸鹽循環(huán)和**酸代謝這幾種途徑。然后結合蛋白質和代謝標志物來預測DKD狀態(tài)。五種機器學習模型表明，組合模型提高了DKD預測的準確性和穩(wěn)定性。圖中展示了RF的結果?？偟膩碚f，組合多組學標志物模型是一種強有力的提高DKD診斷的方法。1.蛋白組學結果表明，α2-巨球蛋白、組織蛋白酶D和CD324可作為檢測DKD進展的潛在生物標志物。2.代謝組學結果表明，半乳糖代謝和甘油脂代謝是DKD的主要代謝途徑，此外甘油-3-半乳糖苷可作為預測DKD的**標志物。3.蛋白組學和代謝組學的組合可以提高預測和診斷DKD的準確性和穩(wěn)定性。血清綜合組學的生物標志物可用于DKD的預警和診斷。該研究為優(yōu)化DKD的管理提供了數據資源。
運用生物技術：TMT標記定量蛋白質組學、PRM蛋白靶向驗證由鹿明生物提供技術支持：2021年12月，上海交通大學張荻課題組在Frontiers in Plant Science發(fā)表題為 TMT-Based Quantitative Proteomic Analysis Reveals the Physiological Regulatory Networks of Embryo Dehydration Protection in Lotus(Nelumbo nucifera)的研究成果，通過TMT標記蛋白質組學和平行反應監(jiān)測蛋白靶向驗證(PRM)技術研究方法，構建了蓮花胚胎脫水保護的生理調控網絡。為揭示荷花種子長壽的脫水保護機制提供了新的見解。label free蛋白組學蛋白質組學原理。
蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學研究案例：2021年12月30日復旦大學附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國科學院上海藥物研究所周虎研究員、中國科學院分子細胞科學***創(chuàng)新中心高大明研究員、復旦大學附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文，通過基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、磷酸化蛋白質組學、微生物組學研究方法對262例肝內膽管*（iCCA）患者的配對**和*旁組織進行了分析，通過繪制肝內膽管*的多維分子圖譜為進一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機制、分子分型、預后等提供了寶貴的資源。蛋白質組學基本策略 研究基礎 研究內容 研究意義背景。上海蛋白組學技術
蛋白質組學的特點蛋白質組和蛋白質組學的概念。遼寧口腔蛋白組學
作者運用iTRAQ標記定量蛋白組學對種子發(fā)育過程中蛋白質表達的定量比較，同時進行GO和KEGG通路富集分析。結果表明所有鑒定的蛋白被分為29類，主要涉及翻譯和碳水化合物代謝。并且作者繪制了p值小于0.01的前20條KEGG通路的氣泡圖。在三對比較中，普遍富集的途徑包括脂肪酸降解、苯丙素生物合成和脂肪酸代謝。其中，參與α-亞麻酸代謝的DAPs在S3 vs. S1組和S4 vs. S1組中都非常活躍。為了評估轉錄組和蛋白質組之間的一致性，以及了解轉錄后的mRNA在蛋白質水平上是如何表現的，作者進行了RNA-seq和iTRAQ分析的聯合分析。證明DEGs和DAPs參與類黃酮的生物合成和脂肪酸代謝。遼寧口腔蛋白組學
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司致力于醫(yī)藥健康，以科技創(chuàng)新實現***管理的追求。歐易生物擁有一支經驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊，以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務，科研檢測，學術研究，技術咨詢。歐易生物始終以本分踏實的精神和必勝的信念，影響并帶動團隊取得成功。歐易生物始終關注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿足市場需求，提高產品價值，是我們前行的力量。