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在本研究中,利用iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)方法對(duì)東京野茉莉種子發(fā)育的4個(gè)時(shí)間點(diǎn)采樣進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)分析。獲得了2338個(gè)蛋白和1473個(gè)DEPs。Mfuzz聚類(lèi)分析顯示,在種子發(fā)育過(guò)程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當(dāng)大的時(shí)序一致性。在四個(gè)發(fā)育時(shí)期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關(guān)鍵時(shí)期:在該階段與脂肪酸生物合成相關(guān)的功能基因和酶蛋白均達(dá)到表達(dá)峰值,同時(shí)種仁內(nèi)部大部分營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)開(kāi)始迅速積累。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個(gè)酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過(guò)程中具有主導(dǎo)作用。蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤(pán)點(diǎn)。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)課程
隨著質(zhì)譜技術(shù)的飛速發(fā)展,特別是離子淌度的引入,增加了一個(gè)新的分離維度,將蛋白質(zhì)組研究推進(jìn)到全新的“4D蛋白質(zhì)組”層面,打破了基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)研究的瓶頸,大幅度的提高掃描速度和檢測(cè)靈敏度,帶來(lái)蛋白質(zhì)組學(xué)在鑒定深度、檢測(cè)周期、定量準(zhǔn)確性等性能的***提升,可以更好的解決大隊(duì)列、復(fù)雜體系以及微量樣本的檢測(cè)。相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了***一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍。經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)化的離子透鏡比較大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,為4D-多組學(xué)建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。CCS 值的加入讓組學(xué)結(jié)果更精細(xì),也使timsTOF Pro 2成為轉(zhuǎn)化組學(xué)應(yīng)用不可或缺的工具。timsTOF Pro 2 能夠?qū)崿F(xiàn)少量細(xì)胞群或生物穿刺樣本等低樣本量的蛋白組定量分析以及磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)分析,在短梯度下實(shí)現(xiàn)蛋白深度覆蓋。遼寧蛋白組學(xué)的價(jià)格蛋白質(zhì)組學(xué),修飾蛋白質(zhì)組,蛋白·修飾·代謝。
3篇經(jīng)典的蛋白組學(xué)和代謝組學(xué)在水產(chǎn)動(dòng)物中的研究。水產(chǎn)動(dòng)物的研究不僅是保障我國(guó)海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時(shí)可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎(chǔ)和技術(shù)支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標(biāo)題:CO2誘導(dǎo)的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對(duì)金氏弧菌的免疫功能:細(xì)胞和蛋白質(zhì)組學(xué)的綜合研究研究對(duì)象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國(guó)科學(xué)院海岸帶研究所運(yùn)用歐易/鹿明生物技術(shù):iTRAQ標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)
TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究案例:2021年11月,南京中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院江蘇省中醫(yī)院?jiǎn)挝唬ㄒ蛔鲃⑹芳蜒芯繂T)及其課題組在MolecularMetabolism期刊發(fā)表的題為“Serumintegrativeomicsrevealsthelandscapeofhumandiabetickidneydisease”的研究成果,通過(guò)TMT標(biāo)記定量蛋白組學(xué)和GC-MS非靶代謝組學(xué)研究方法,發(fā)現(xiàn)了糖尿病腎病(DKD)特征,篩選了蛋白和代謝容組合生物標(biāo)志物。為優(yōu)化糖尿病腎病(DKD)管理提供了豐富且開(kāi)放訪(fǎng)問(wèn)的數(shù)據(jù)資源。中文標(biāo)題:血清綜合組學(xué)揭示人類(lèi)糖尿病腎病情況研究對(duì)象:人血清發(fā)表期刊:MolecularMetabolism影響因子:7.422發(fā)表時(shí)間:2021年11月1日合作單位:江蘇省中醫(yī)院運(yùn)用生物技術(shù):TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)(其中部分工作由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)、ELISA單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué),極微量樣本檢測(cè)。
通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)分析檢測(cè)了經(jīng)M-Exos處理的HBMECs的改變。外泌體***了HBMECs,在0、24和48小時(shí)各種基因的表達(dá)增加(圖2A)。此外,熱圖分析揭示了不同表達(dá)的功能基因,包括與炎癥、細(xì)胞增殖、免疫調(diào)節(jié)和血管生成相關(guān)的因素(圖2B-E)。時(shí)序分析表明,HBMECs中標(biāo)記基因的上調(diào)與炎癥因子IL3RA有關(guān),增殖相關(guān)蛋白CD40和免疫調(diào)節(jié)因子TNFRSF10C(圖2F-H)。作者主要研究外泌體是否促進(jìn)人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的血管生成能力,因此初步驗(yàn)證了M-Exos***后血管生成相關(guān)基因的表達(dá)。蛋白質(zhì)印跡結(jié)果顯示血管生成相關(guān)基因FlK1和ANGPT1的表達(dá)明顯增強(qiáng)(圖2I)。綜上所述,結(jié)果證實(shí)了M-Exos誘導(dǎo)了人腦微血管內(nèi)皮細(xì)胞的功能改變。TMT/iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué) 差異表達(dá)蛋白質(zhì)組分析研究。山東定向蛋白組學(xué)
單細(xì)胞組學(xué) 單細(xì)胞蛋白組學(xué) 蛋白質(zhì)組學(xué) 。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)課程
蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)研究案例:2021年12月30日復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院樊嘉院士、中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所周虎研究員、中國(guó)科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)***創(chuàng)新中心高大明研究員、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院**教授課題組合作在Cancer Cell上發(fā)表題為“Proteogenomic characterization identifies clinically relevant subgroups of intrahepatic cholangiocarcinoma”的研究論文,通過(guò)基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、磷酸化蛋白質(zhì)組學(xué)、微生物組學(xué)研究方法對(duì)262例肝內(nèi)膽管*(iCCA)患者的配對(duì)**和*旁組織進(jìn)行了分析,通過(guò)繪制肝內(nèi)膽管*的多維分子圖譜為進(jìn)一步鑒定iCCA的分子發(fā)病機(jī)制、分子分型、預(yù)后等提供了寶貴的資源。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)課程
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司致力于醫(yī)藥健康,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)***管理的追求。歐易生物深耕行業(yè)多年,始終以客戶(hù)的需求為向?qū)?,為客?hù)提供***的科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢(xún)。歐易生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。歐易生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對(duì)自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專(zhuān)注與執(zhí)著使歐易生物在行業(yè)的從容而自信。