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使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析,與GFP-群體相比,在GFP+細(xì)胞中TM處理后,線粒體復(fù)合物IV的多個(gè)亞基被特異性下調(diào),對(duì)下調(diào)的蛋白質(zhì)進(jìn)行基因本體 (GO)分析,顯示參與線粒體電子傳遞鏈 (ETC) 的通路富集。同時(shí)作者還分析了從人 LM2 細(xì)胞系中分選的 LM2 GFP+和 GFP- 細(xì)胞,在 TM 處理 48 小時(shí)后蛋白組學(xué)分析,揭示了GFP+細(xì)胞優(yōu)先富集,同時(shí)揭示了線粒體 ETC 相關(guān)的通路。因此,TM 處理特別影響具有更高細(xì)胞內(nèi)銅水平的 SOX2/OCT4+ 細(xì)胞中的線粒體 ETC 通路。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線粒體功能的途徑。細(xì)胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶,是線粒體ETC的終末酶。蛋白組學(xué)翻譯后修飾篩選,檢測(cè),鑒定,定性,定量。江西蛋白組學(xué)非標(biāo)記定量
作者通過(guò)泛素化蛋白組學(xué)分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標(biāo)題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學(xué)分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對(duì)象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時(shí)間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)運(yùn)用生物技術(shù):TMT蛋白質(zhì)組學(xué)、泛素化蛋白質(zhì)組學(xué)(其中部分?jǐn)?shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術(shù)支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過(guò)蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機(jī)制。本文的多組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。山東蛋白組學(xué) 數(shù)據(jù)分析靶向蛋白質(zhì)組學(xué),信號(hào)通路蛋白靶點(diǎn)高通量分析。
iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法:2021年4月,南京林業(yè)大學(xué)喻方圓教授(一作:吳岐奎)課題組在JournaloftheScienceofFoodandAgriculture期刊發(fā)表了題為“ProteomicanalysisofmetabolicmechanismsassociatedwithfattyacidbiosynthesisduringStyraxtonkinensiskerneldevelopment”的研究成果,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)+iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)研究方法,分析東京野茉莉種子發(fā)育過(guò)程中脂肪酸生物合成相關(guān)基因的表達(dá)趨勢(shì),確定油脂積累的主要影響因子并構(gòu)建其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。為野茉莉?qū)僦参锓N子油用研究和后續(xù)功能分析研究提供了一定的研究基礎(chǔ)。
定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究:2022年2月,上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果,通過(guò)iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)等技術(shù)對(duì)香菇菌絲進(jìn)行定量蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)氧化應(yīng)激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過(guò)程,并對(duì)其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機(jī)制有了新的認(rèn)識(shí)。涉及的歐易/鹿明生物服務(wù)產(chǎn)品:iTRAQ標(biāo)記定量蛋白組學(xué)、GC-MS非靶向代謝組學(xué)修飾蛋白質(zhì)組試-蛋白質(zhì)組學(xué) 解決方案。
4D蛋白質(zhì)組學(xué):2022年3月,牛津大學(xué)Julian C. Knight教授課題組在cell發(fā)表的題為“A blood atlas of COVID-19 defines hallmarks of disease severity and specificity”的研究成果,通過(guò)4D蛋白質(zhì)組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組技術(shù)、流式技術(shù)、單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)等研究方法,為不同COVID-19嚴(yán)重程度的患者提供了一個(gè)綜合的多組圖譜,并將其與流感和敗血癥患者與健康志愿者進(jìn)行了綜合比較,將支持未來(lái)的COVID-19藥物開發(fā)、臨床試驗(yàn)設(shè)計(jì)和個(gè)性化藥物方法。中文標(biāo)題:COVID-19的血液圖譜定義了疾病嚴(yán)重程度和特異性的特征研究對(duì)象:血液發(fā)表期刊:Cell影響因子:41.582發(fā)表時(shí)間:2022.3運(yùn)用生物技術(shù):4D蛋白組學(xué)技術(shù)蛋白組學(xué)近期研究進(jìn)展的盤點(diǎn)。福建植物蛋白組學(xué)研究
蛋白質(zhì)組學(xué)的特點(diǎn)蛋白質(zhì)組和蛋白質(zhì)組學(xué)的概念。江西蛋白組學(xué)非標(biāo)記定量
蛋白組學(xué)研究實(shí)用案例:東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長(zhǎng)劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果,通過(guò)蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法,建立IL-10細(xì)胞囊泡高表達(dá)模型的構(gòu)建,提出并驗(yàn)證了IL-10細(xì)胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說(shuō),探究了IL-10細(xì)胞外囊泡作為新型納米藥物的機(jī)理。中文標(biāo)題:細(xì)胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向:新藥研發(fā)及其機(jī)制研究發(fā)表期刊:Scienceadvances影響因子:14.136發(fā)表單位:中國(guó)南京東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運(yùn)用生物技術(shù):LC-MS/MS蛋白組學(xué)(由鹿明生物提供技術(shù)支持)江西蛋白組學(xué)非標(biāo)記定量
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