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湖北空間代謝組學(xué)和心臟

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-01-11

空間代謝組學(xué):繪制了不同代謝物在組織內(nèi)濃度的圖像,直觀顯示了代謝物在NCE細(xì)胞、基質(zhì)細(xì)胞和**細(xì)胞的濃度差異。在正離子和負(fù)離子模式下檢測(cè)到的質(zhì)量分別用紅色加號(hào)和藍(lán)色減號(hào)表示。組織邊緣用黑色邊框勾勒出輪廓,但**區(qū)域還包含一些無(wú)法單獨(dú)注釋的*細(xì)胞與基質(zhì)的區(qū)域。ADP=二磷酸腺苷,ATP=三磷酸腺苷,GPEA=甘油磷酰乙醇胺,HBCt=羥基丁酰肉堿,HE=蘇木精和伊紅,LPC=溶血磷脂酰膽堿,NAA=N-乙酰天冬氨酸,PE=磷脂酰乙醇胺,PI=磷脂酰肌醇空間代謝組學(xué)的力量探究前列腺*。湖北空間代謝組學(xué)和心臟

展示了空間代謝組成像技術(shù)的應(yīng)用。這一分析***表明脫髓鞘后新形成的髓鞘具有與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。因此,這種HSL方法學(xué)可能**提高目前對(duì)多發(fā)性硬化癥再髓鞘形成的理解,并可能為多發(fā)性硬化癥研究中評(píng)估再髓鞘形成***提供一種新的策略。此外,HSL方法可以針對(duì)***的組織量身定做,為生物醫(yī)學(xué)科學(xué)中的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分提供至關(guān)重要的見(jiàn)解。該研究開(kāi)發(fā)了一種基于拉曼光譜、解吸電噴霧電離質(zhì)譜(空間代謝組學(xué))和免疫熒光成像的相關(guān)脂質(zhì)組成像(HSL)方法,研究多發(fā)性硬化癥病變中的再髓鞘形成與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。結(jié)果通過(guò)對(duì)脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分的研究為再髓鞘化***提供可能性。湖北空間代謝組學(xué)和心臟空間代謝組支持個(gè)性化定制。

空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類(lèi)似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。

在空間上的代謝變化表明,在東莨菪堿***后,大鼠腦微區(qū)的代謝網(wǎng)絡(luò)發(fā)生紊亂。但是代謝物和代謝酶是代謝網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵因素,基于空間分辨的代謝組學(xué)信息為發(fā)現(xiàn)酶或基因異常提供了線索,但若要完成完整的代謝網(wǎng)絡(luò)分析必須進(jìn)一步驗(yàn)證蛋白質(zhì)和基因表達(dá)水平。本文作者開(kāi)發(fā)了一種空間分辨代謝網(wǎng)絡(luò)作圖方法,通過(guò)無(wú)需衍生化、特定標(biāo)記或復(fù)雜樣品預(yù)處理的高通量AFADESI-MSI方法和代謝組學(xué)策略,在具有復(fù)雜結(jié)構(gòu)化腦組織中發(fā)現(xiàn)代謝分子變化。能檢測(cè)出多種極性?xún)?nèi)源性代謝物,并繪制相關(guān)代謝網(wǎng)絡(luò),提供組織微區(qū)分布的圖譜。還將多種功能性小分子(例如核苷酸、多胺、肌酸、神經(jīng)酰胺代謝物)含量分布可視化。空間代謝組特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。

空間代謝組學(xué)探究MYC、SREBP1與**發(fā)生的能量機(jī)制探索。斯坦福大學(xué)Dean W. Felsher課題組在Cell Metabolism發(fā)表的題為“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通過(guò)空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術(shù)研究*基因MYC促進(jìn)**發(fā)生機(jī)制,發(fā)現(xiàn)MYC與膽固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白(SREBP1)協(xié)同調(diào)節(jié)脂質(zhì)生成,從而促進(jìn)疾病的發(fā)生。中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)所必需的脂肪生成研究對(duì)象:小鼠蛋白質(zhì)組學(xué)的研究方法。湖北空間代謝組學(xué)和心臟

空間代謝組具有覆蓋范圍廣,靈敏度高,動(dòng)態(tài)范圍寬。湖北空間代謝組學(xué)和心臟

質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術(shù),能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構(gòu)、含量和空間分布信息。相對(duì)于其他成像方法(如熒光成像、放射性標(biāo)記成像等),該技術(shù)無(wú)需化學(xué)或放射性標(biāo)記、不需復(fù)雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢(shì)。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識(shí)別其生物學(xué)功能。湖北空間代謝組學(xué)和心臟

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