空間代謝組學助力醫(yī)科院藥物所蔣建東團隊探究靶向納米技術促進小檗堿肝臟吸收機制。中國醫(yī)學科學院藥物研究所蔣建東團隊課題組在NatureCommunications發(fā)表了題為“Liver-targetnanotechnologyfacilitatesberberinetoamelioratecardio-metabolicdiseases"的研究成果，通過AFADESI-MSI空間代謝組學、WesternBlotting、RT-PCR、Flowcytometry和ELISA等技術研究BBR-CTA-Mic對高脂飲食小鼠的代謝紊亂和******效果，發(fā)現(xiàn)BBR-CTA-Mic不僅可有效促進肝臟沉積和肝細胞攝取BBR，還能降低血漿中的脂質(zhì)和促炎細胞因子。空間代謝組通過質(zhì)譜成像技術。北京空間代謝組學基本研究流程
本篇為2021年8月，國家**中心中國醫(yī)學院科學院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學技術團隊合作在醫(yī)學一區(qū)消化道領域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果，通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(研究方法，整合了宏基因組的數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結(jié)直腸*診斷的代謝標志物，建立的相關預測模型顯示出較高診斷準確性，為結(jié)直腸*早期診斷奠定堅實基礎。在本研究中，作者對血清代謝組學和糞便宏基因組測序的結(jié)果進行整合分析，確定了一組與腸道微生物群密切相關的CRC和腺瘤患者的血清代謝物，并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關血清代謝物 (GMSM) 策略，可準確區(qū)分CRC和腺瘤患者（統(tǒng)稱為結(jié)直腸異常）與正常健康個體。青?？臻g代謝組學研究意義空間代謝組得到了廣大醫(yī)學領域科研工作者的信任。
隊列1：收集手術切除的食管腺*（EA）組織和與之匹配的健康食管上皮組織（MHEE）。隊列2：收集健康食管上皮組織（來自健康志愿者，HEE）和未經(jīng)***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活檢樣本，用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進程中甘油磷脂的變化，以及隊列1的外部驗證。樣本制備：樣本制成冰凍組織切片，并結(jié)合H&E染色。研究方法：空間代謝組學；qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達；細胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因；免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達。
作者進行了空間代謝組學(～50μm的空間分辨率)，并根據(jù)m/z848.63和m/z844.52對主要的髓鞘標志物進行了成像，推測它們分別屬于Cer(D18：1/24：1)和PC(38：6)(圖2G)。白質(zhì)和灰質(zhì)的代表性質(zhì)譜如圖2H所示。結(jié)果表明，使用拉曼光譜結(jié)構(gòu)信息和空間代謝組學對髓鞘中的脂質(zhì)進行特定的成分分析是可能的。對單個有髓組織成分光譜的分析證實，構(gòu)成有髓組織光譜的主要分子是脂質(zhì)，包括腦苷脂、膽固醇、鞘磷脂、磷脂酰膽堿，以及程度較小的蛋白質(zhì)(圖2F)?？臻g代謝組三個維度的分析。
空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系（BCL）進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達，在MYC誘導的肝細胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達，但不降低MYC基因的表達。其次，ChIP的MYC與啟動子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此，MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。誰還在盤點空間代謝組學專題?4篇,總IF:82,篇篇經(jīng)典~。河南空間代謝組學研究意義
質(zhì)譜成像技術可以實現(xiàn)生物上千代謝物的定性。北京空間代謝組學基本研究流程
再帕爾·阿不力孜、賀玖明研究團隊運用空間代謝組學繪制大鼠腦代謝網(wǎng)絡圖。2021年4月，中國醫(yī)學科學院藥物研究所天然藥物活性物質(zhì)與功能國家重點實驗室再帕爾·阿不力孜、賀玖明團隊在分析化學一區(qū)《Analytical Chemistry》期刊發(fā)表封面文章，題為“Mapping metabolic networks in the brain by using ambient mass spectrometry imaging and metabolomics”的研究成果，通過空間代謝組學技術，***揭示了大鼠腦代謝網(wǎng)絡，深入解析了東莨菪堿致大鼠記憶功能障礙模型腦的代謝變化。北京空間代謝組學基本研究流程
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