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黑龍江空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

來源: 發(fā)布時間:2023-03-22

AFADESI空間代謝組技術:免標記、無需基質(zhì)噴涂、周期短、定位準是AFADESI空間代謝組技術的主要特點。該技術作為一種新型的分子影像技術,能夠獲得組織***中1000Da以下代謝物和藥物的定性、定量、定位三個維度的信息。在獲得AFADESI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,經(jīng)過2021年一整年的研發(fā)及項目運營落地,鹿明生物積贊了如下優(yōu)勢。一、**支持AFADESI-MSI原創(chuàng)團隊****-賀玖明教授(中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院藥物研究所PI)全力支持,參與的基于AFADESI平臺發(fā)表的方法學及應用文章篇已在Gut、PNAS、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上發(fā)表10+篇。質(zhì)譜成像技術可以實現(xiàn)生物上千代謝物的定性。黑龍江空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學:質(zhì)譜成像方法提供了一種直接獲取代謝網(wǎng)絡信息的途徑,以系統(tǒng)地深入了解大腦的代謝活動。基于KEGG數(shù)據(jù)庫的Metaboanalyst軟件進行代謝網(wǎng)絡分析。共找到20條KEGG代謝通路,包含126個具有微區(qū)信息的代謝物,圖2顯示了涉及丙氨酸-天冬氨酸和谷氨酸代謝、花生四烯酸代謝、精氨酸和脯氨酸代謝、肌酸途徑、GABA能突觸、葡萄糖代謝、谷胱甘肽代謝、甘油磷脂代謝、甘氨酸-絲氨酸和蘇氨酸的代謝、組氨酸代謝、賴氨酸代謝、苯丙氨酸代謝、多胺代謝途徑、嘌呤代謝、嘧啶代謝和TCA循環(huán)、色氨酸代謝、酪氨酸代謝、纈氨酸-亮氨酸和異亮氨酸代謝和類固醇***合成途徑。重慶空間代謝組學在植物葉片一文讀懂空間代謝組學:DESI-IMS與MALDI-IMS的區(qū)別。

隊列1:收集手術切除的食管腺*(EA)組織和與之匹配的健康食管上皮組織(MHEE)。隊列2:收集健康食管上皮組織(來自健康志愿者,HEE)和未經(jīng)***的食管炎(IEE)、巴雷特化生(BM)、巴雷特增生(BD)和食管腺*(EA)活檢樣本,用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進程中甘油磷脂的變化,以及隊列1的外部驗證。樣本制備:樣本制成冰凍組織切片,并結(jié)合H&E染色。研究方法:空間代謝組學;qPCR檢測甘油磷脂合成通路中基因的表達;細胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因;免疫組化用于分析隊列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關鍵酶的表達。

本篇為2021年8月,國家**中心中國醫(yī)學院科學院**醫(yī)院崔巍研究員與專業(yè)多組學技術團隊合作在醫(yī)學一區(qū)消化道領域國際期刊《GUT》期刊發(fā)表了題的研究成果,通過非靶向代謝組、靶向代謝組以及AFADESI-MSI空間代謝組學(研究方法,整合了宏基因組的數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了可用于腺瘤及結(jié)直腸*診斷的代謝標志物,建立的相關預測模型顯示出較高診斷準確性,為結(jié)直腸*早期診斷奠定堅實基礎。在本研究中,作者對血清代謝組學和糞便宏基因組測序的結(jié)果進行整合分析,確定了一組與腸道微生物群密切相關的CRC和腺瘤患者的血清代謝物,并基于代謝物研發(fā)了腸道微生物組相關血清代謝物 (GMSM) 策略,可準確區(qū)分CRC和腺瘤患者(統(tǒng)稱為結(jié)直腸異常)與正常健康個體。歐易生物空間代謝組學適合整體方案,助力科研,。

在獲得AFADESI平臺原創(chuàng)團隊全力支持下,截止2021年9月,鹿明生物已經(jīng)完成共計近千例樣本經(jīng)驗,包括心臟、腦、**、腸道、肝臟、腎臟、皮膚等十幾種組織樣本空間代謝組學檢測及分析,檢測物質(zhì)涵蓋膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物。歡迎各老師咨詢~空間多組學檢測平臺2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。歐易生物、鹿明生物2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個平臺,已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項目10+。質(zhì)譜成像技術可以實現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性。山西空間代謝組學 肝炎

空間代謝組技術流程 。黑龍江空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作為一種新型的分子影像技術,能夠直接從生物組織中獲得大量已知或未知的內(nèi)源性代謝物和外源***物等分子的結(jié)構、含量和空間分布信息。相對于其他成像方法(如熒光成像、放射性標記成像等),該技術無需化學或放射性標記、不需復雜樣品前處理,具有高特異性、高通量和空間信息保留的突出優(yōu)勢。質(zhì)譜成像技術可以實現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性、定量和定位分析,結(jié)合生物信息學分析,發(fā)展為空間代謝組學方法,可從生物組織原位發(fā)現(xiàn)差異代謝物,并識別其生物學功能。黑龍江空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

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