一些實(shí)現(xiàn)空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的重要技術(shù),**早可以追溯到二十世紀(jì)七十年代,長(zhǎng)期以來(lái),各種形式的原位雜交技術(shù)(ISH)已用于可視化空間中的基因表達(dá)。從技術(shù)原理中不難看出,空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)**為特殊的載玻片。ISS 方法通常通過(guò)基于連接(SBL)或者基于合成(SBS) 的原位測(cè)序, 確定靶向基因序列或非靶向的 cDNA 短片段,**終獲得空間轉(zhuǎn)錄組信息。根據(jù)測(cè)序鏈接策略的不同(SOLiD,cPAL和SEDAL),基于 SBL 的原位測(cè)序技術(shù)方法的代表性技術(shù)分別為 FISSEQ,ISS,STARmap。作者借助空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)探究人類(lèi)心臟在發(fā)育過(guò)程中的基因表達(dá)特征和細(xì)胞圖譜變化。福建歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組多少錢(qián)
空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些?一、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質(zhì)性:同時(shí)了解患病組織中的細(xì)胞類(lèi)型及其定位有助于解決空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學(xué)問(wèn)題。在不同的環(huán)境下,明智地選擇這些方法在生物學(xué)研究中也是至關(guān)重要的,例如在神經(jīng)科學(xué)中,基于FISH的方法很普遍;基于LCM的方法適用于小樣本(例如臨床樣本)以及整個(gè)轉(zhuǎn)錄組或基因組分析。二、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜:借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項(xiàng)研究通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),得到多個(gè)***的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜(相關(guān)研究后續(xù)會(huì)在如下專(zhuān)輯更新)。山西空間轉(zhuǎn)錄組領(lǐng)域空間轉(zhuǎn)錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數(shù)據(jù)的技術(shù),從而解析單個(gè)組織切片中的所有mRNA。
空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí),多方位測(cè)量轉(zhuǎn)錄組譜。然而,現(xiàn)有的分析方法并沒(méi)有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問(wèn)題。來(lái)自美國(guó)的科研團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了BayesSpace,這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法,它使用來(lái)自空間鄰域的信息來(lái)增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類(lèi)分析。BayeSpace通過(guò)使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入,無(wú)縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中,輸出同樣存儲(chǔ)在SingleCellExperiment對(duì)象中,該對(duì)象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。
歐易生物自引進(jìn)10x Visium空間轉(zhuǎn)錄組以來(lái)已經(jīng)完成了上百例樣本測(cè)序,在樣本包埋、切片、實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)分析上積累了大量寶貴的經(jīng)驗(yàn)。本次培訓(xùn)班旨在跟廣大科研工作者介紹空間轉(zhuǎn)錄組的研究熱點(diǎn)和方案設(shè)計(jì),分享歐易生物在樣本處理、實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗(yàn),助力各位科研工作者取得新的突破。招生對(duì)象:A、對(duì)空間轉(zhuǎn)錄組感興趣,期望了解空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù),或近期準(zhǔn)備開(kāi)展空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序項(xiàng)目B、項(xiàng)目已經(jīng)開(kāi)展,需要深入挖掘數(shù)據(jù)的科研工作者。分享歐易生物在空間轉(zhuǎn)錄組樣本處理、實(shí)驗(yàn)和數(shù)據(jù)挖掘上的成功經(jīng)驗(yàn),助力各位科研工作者取得新的突破。
空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)作為當(dāng)今前沿的科研技術(shù),相信很多老師都希望將其運(yùn)用于自己的課題中,快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過(guò)質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“歐易生物”)主辦的“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)培訓(xùn)班”落下帷幕。培訓(xùn)中,歐易講師團(tuán)隊(duì)以其豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)及專(zhuān)業(yè)的生信能力,從空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程、測(cè)序原理、實(shí)驗(yàn)實(shí)操及數(shù)據(jù)挖掘等多維度,向遠(yuǎn)道而來(lái)的學(xué)員們展開(kāi)了系統(tǒng)性的培訓(xùn)。
10x? Genomics空間轉(zhuǎn)錄組用于文庫(kù)構(gòu)建的每張載玻片上有四個(gè)捕獲區(qū)域,每個(gè)捕獲區(qū)域的大小為6.5x6.5mm。福建歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用
空間轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類(lèi):機(jī)械和光學(xué)。福建歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組多少錢(qián)
10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達(dá)解決方案是目前***一個(gè)高通量空間轉(zhuǎn)錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案巧妙的將單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)原理和組織切片染色結(jié)合在一起,從而研究空間分辨率下整個(gè)轉(zhuǎn)錄組 mRNA 的表達(dá)情況,同時(shí)在同一組織切片中獲得組織學(xué)相關(guān)信息??臻g轉(zhuǎn)錄組相關(guān)的顯微解剖技術(shù)通常分為兩類(lèi):機(jī)械和光學(xué)。前者包括 Tomo-seq 等,通過(guò)沿感興趣軸,利用冷凍切片機(jī)進(jìn)行組織切片,然后在每個(gè)切片上均進(jìn)行 RNA 測(cè)序。10x 提供的載玻片分為兩種:用于摸索組織比較好透化時(shí)間的組織優(yōu)化玻片和用于正式實(shí)驗(yàn)的基因表達(dá)玻片。福建歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組多少錢(qián)
上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司是一家檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷(xiāo)售,儀器儀表的銷(xiāo)售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢(xún)。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務(wù)實(shí)、誠(chéng)實(shí)可信的企業(yè)。歐易生物作為檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷(xiāo)售,儀器儀表的銷(xiāo)售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢(xún)、技術(shù)服務(wù),會(huì)務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢(xún)。的企業(yè)之一,為客戶(hù)提供良好的科研服務(wù),科研檢測(cè),學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢(xún)。歐易生物始終以本分踏實(shí)的精神和必勝的信念,影響并帶動(dòng)團(tuán)隊(duì)取得成功。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康行業(yè)。滿(mǎn)足市場(chǎng)需求,提高產(chǎn)品價(jià)值,是我們前行的力量。