1. 10x Genomics公司提供的Visium空間基因表達解決方案是目前可選的一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案可以輕松地將空間轉錄組學技術應用到組織切片和染色的標準方法中,從而研究空間分辨率下整個轉錄組mRNA的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息??臻g轉錄組是一項前沿技術,涉及到很多細節(jié)方面的準備工作,例如組織類型的選擇、前期預實驗的設計、病理區(qū)域的確認等一系列內容。而且實驗中存在很多不確定性因素,處理不慎容易導致整個項目失敗。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。青??臻g轉錄組多少錢
空間轉錄組的方法和技術有哪些?廣義上講,現有的生成空間分辨轉錄組學的方法可分為四類:用于空間重建的計算策略和組學實驗的組合,使用激光捕獲顯微切割(LCM)結合高通量進行直接測量,使用熒光物質的基于圖像的原位轉錄組學 ,以及基于寡核苷酸的空間條形碼再加上高通量。每種方法都有其優(yōu)點和缺點??臻g重構的計算策略:這種計算方法可以充分利用內在基因表達模式或共表達的趨勢,從單個細胞的大量轉錄組數據中重構細胞間的環(huán)境。然而,這些推論方法在某些情況下*呈現空間趨勢或特定組織的總體布局?;贚CM的方法:基于LCM的轉錄組學或基因組學成功地獲得了單個細胞的空間轉錄組,盡管其通量很低,但是在可以標記成千上萬個單個細胞位置的多路復用條形碼策略可行之前,將少量細胞的數據粗略地整合到構成***的巨大背景中,可能具有一定價值?;趫D像的原位轉錄組學:基于圖像的原位轉錄組學在很大程度上增加了可檢測區(qū)域,但也存在一些問題,例如幾種smFISH方法很難從包括信號干擾、轉錄本積累等復雜背景中提取單個細胞??臻g條形碼加高通量:費用較高且無法在單個細胞中獲得轉錄組。青海歐易生物空間轉錄組有什么用獲取空間轉錄組中各個spot的細胞類型注釋信息。
空間轉錄組技術作為當今前沿的科研技術,相信很多老師都希望將其運用于自己的課題中,快速發(fā)表高分文章。歐易生物具有上百例空間轉錄組項目執(zhí)行經驗,致力通過質量的服務,助力各位科研工作者取得新的突破。由上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司(以下簡稱“歐易生物”)主辦的“空間轉錄組學培訓班”落下帷幕。培訓中,歐易講師團隊以其豐富的項目經驗及專業(yè)的生信能力,從空間轉錄組學的發(fā)展歷程、測序原理、實驗實操及數據挖掘等多維度,向遠道而來的學員們展開了系統(tǒng)性的培訓。
10x Genomics 公司提供的 Visium 空間基因表達解決方案是目前***一個高通量空間轉錄組的商業(yè)化解決方案。該解決方案巧妙的將單細胞測序技術原理和組織切片染色結合在一起,從而研究空間分辨率下整個轉錄組 mRNA 的表達情況,同時在同一組織切片中獲得組織學相關信息??臻g轉錄組相關的顯微解剖技術通常分為兩類:機械和光學。前者包括 Tomo-seq 等,通過沿感興趣軸,利用冷凍切片機進行組織切片,然后在每個切片上均進行 RNA 測序。10x 提供的載玻片分為兩種:用于摸索組織比較好透化時間的組織優(yōu)化玻片和用于正式實驗的基因表達玻片??臻g轉錄組避免了組織中細胞位置信息的丟失。
1. 空間轉錄組是一種用于從空間層面上解析RNA-seq數據的技術,從而解析單個組織切片中的所有mRNA??臻g條形碼逆轉錄oligo(dT)引物在顯微鏡載玻片表面的有序附著,使得在mRNA樣品處理和后續(xù)測序過程中位置信息的編碼和獲取成為可能。單細胞RNA測序或組織樣本RNA測序,均無法為研究人員提供精確的空間信息。通過空間轉錄組技術可獲取組織中具體的位置的轉錄信息,為研究和診斷提供有效數據支撐。10x Genomics空間轉錄組技術可以應用于免疫、發(fā)育、神經和病理等研究方向。研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉錄組學研究相對滯后。甘肅歐易生物空間轉錄組報價
scRNA-seq 技術的進步啟發(fā)了利用高分辨率轉錄組定量分析與空間轉錄組學數據的互補性質的新方法。青??臻g轉錄組多少錢
人類細胞圖譜項目的主要目標之一是描述所有細胞類型的空間關系。同時基于表達特征對多種細胞類型進行空間映射,有助于研究不同細胞類型之間的相互作用。已經發(fā)展了一些策略來檢測單細胞分辨率的空間基因表達譜,如Slide-seq、seqFISH或MERFISH。為了更有效地為研究群體探索空間基因表達數據,我們構建了SpatialDB數據庫用于空間解析的轉錄組。
人類細胞圖譜項目極大地推動了單細胞水平的生命科學研究??臻g轉錄組學技術的發(fā)展和空間基因表達數據的快速積累是未來的發(fā)展趨勢。我們將繼續(xù)收集新的技術和數據集來更新SpatialDB。此外,我們將整合更多的工具和數據源來分析數據. 青??臻g轉錄組多少錢
上海歐易生物醫(yī)學科技有限公司位于聯航路1188號25幢,擁有一支專業(yè)的技術團隊。致力于創(chuàng)造***的產品與服務,以誠信、敬業(yè)、進取為宗旨,以建歐易生物產品為目標,努力打造成為同行業(yè)中具有影響力的企業(yè)。我公司擁有強大的技術實力,多年來一直專注于檢驗檢測服務。(依法須經批準的項目,經相關部門批準后方可開展經營活動,具體經營項目以相關部門批準文件或許可證件為準)一般項目:生物醫(yī)藥產品、生化產品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產品(除危險品化學品、監(jiān)控化學品、易制毒化學品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關技術咨詢、技術服務,會務服務,企業(yè)管理咨詢。的發(fā)展和創(chuàng)新,打造高指標產品和服務。自公司成立以來,一直秉承“以質量求生存,以信譽求發(fā)展”的經營理念,始終堅持以客戶的需求和滿意為重點,為客戶提供良好的科研服務,科研檢測,學術研究,技術咨詢,從而使公司不斷發(fā)展壯大。