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遼寧10x空間轉(zhuǎn)錄組

來源: 發(fā)布時(shí)間:2021-12-04

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的重要是根據(jù)每個(gè)芯片上每個(gè)spot的基因表達(dá)信息進(jìn)行聚類,然后將spot根據(jù)坐標(biāo)位置序列放回到組織的圖像上,同時(shí)可以對每個(gè)gene在組織上表達(dá)的空間位置進(jìn)行定位。獲得測序數(shù)據(jù)后,首先利用Space Ranger 軟件可以自動化的對圖像進(jìn)行處理、數(shù)據(jù)比對和Barcode處理。另外一個(gè)軟件Loupe Cell Browser是一個(gè)適用于Windows和MacOS的桌面應(yīng)用程序,它可以快速、輕松地可視化和分析10X Visium數(shù)據(jù)。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。通過培訓(xùn)系統(tǒng)掌握空間轉(zhuǎn)錄組測序原理和方案設(shè)計(jì)思路,助力科學(xué)研究。遼寧10x空間轉(zhuǎn)錄組

空間轉(zhuǎn)錄組是在組織原位檢測基因表達(dá)的一種技術(shù),與bulk RNA-seq或單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序相比,空間轉(zhuǎn)錄組避免了組織中細(xì)胞位置信息的丟失,使得我們在檢測基因表達(dá)的同時(shí)獲得基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。已發(fā)表的關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)有Slide-seq , LCM-seq , seqFISH, MERFISH , Liver single cell zonation , Geo-seq and Tomo-seq。這些方法或是在細(xì)胞數(shù)量上限制較大,或是存在有效測序深度不足等問題。正是由于空間轉(zhuǎn)錄組可以從多維度解析生物學(xué)過程的特點(diǎn),近年來關(guān)于空間轉(zhuǎn)錄組無論是在技術(shù)開發(fā),還是大規(guī)模應(yīng)用或商業(yè)化,都得到蓬勃發(fā)展。


歐易生物空間轉(zhuǎn)錄組多少錢研究的***主要集中于人類和小鼠的大腦,而其他***(例如肝臟)的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究相對滯后。

空間轉(zhuǎn)錄組的應(yīng)用有哪些?一、發(fā)現(xiàn)疾病的空間異質(zhì)性:同時(shí)了解患病組織中的細(xì)胞類型及其定位有助于解決空間分辨的轉(zhuǎn)錄組學(xué)問題。在不同的環(huán)境下,明智地選擇這些方法在生物學(xué)研究中也是至關(guān)重要的,例如在神經(jīng)科學(xué)中,基于FISH的方法很普遍;基于LCM的方法適用于小樣本(例如臨床樣本)以及整個(gè)轉(zhuǎn)錄組或基因組分析。二、構(gòu)建空間轉(zhuǎn)錄組圖譜:借助于空間分辨的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué),建立圖譜可能是在分子水平上研究生物體結(jié)構(gòu)的重要步驟。目前的多項(xiàng)研究通過單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)結(jié)合空間轉(zhuǎn)錄技術(shù),得到多個(gè)***的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組圖譜(相關(guān)研究后續(xù)會在如下專輯更新)。

空間基因表達(dá)技術(shù)能夠在保留空間背景信息的同時(shí),多方位測量轉(zhuǎn)錄組譜。然而,現(xiàn)有的分析方法并沒有解決技術(shù)分辨率有限或有效利用空間信息的問題。來自美國的科研團(tuán)隊(duì)開發(fā)了BayesSpace,這是一種完全貝葉斯統(tǒng)計(jì)方法,它使用來自空間鄰域的信息來增強(qiáng)空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分辨率并進(jìn)行聚類分析。BayeSpace通過使用的Bioconductor SingleCellExperiment數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)將預(yù)處理數(shù)據(jù)作為輸入,無縫集成到空間轉(zhuǎn)錄組分析工作流中,輸出同樣存儲在SingleCellExperiment對象中,該對象可用于下游分析。歐易生物具有上百例空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目執(zhí)行經(jīng)驗(yàn),致力通過質(zhì)量的服務(wù),助力各位科研工作者取得新的突破。空間轉(zhuǎn)錄組是一項(xiàng)前沿技術(shù),涉及到很多細(xì)節(jié)方面的準(zhǔn)備工作。

歐易生物高級技術(shù)支持陳老師首先給大家介紹了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的發(fā)展歷程、測序流程及原理。緊接著,歐易生物技術(shù)支持姚老師針對目前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)發(fā)表的一系列高分文章進(jìn)行了方案設(shè)計(jì)的解析。姜老師給大家詳細(xì)介紹了空間轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目樣本準(zhǔn)備、切片、貼片等實(shí)驗(yàn)過程及注意事項(xiàng),并帶領(lǐng)大家到實(shí)驗(yàn)室實(shí)地觀摩了整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程,并就其中細(xì)節(jié)進(jìn)行了講解。董老師針對空間轉(zhuǎn)錄組10x Space Ranger的分析原理及結(jié)果進(jìn)行了詳細(xì)解析,并介紹了使用Seurat包進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘的標(biāo)準(zhǔn)分析流程。在未來的5-10年里,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)妥妥的是技術(shù)熱點(diǎn)。品質(zhì)空間轉(zhuǎn)錄組應(yīng)用

空間轉(zhuǎn)錄組細(xì)胞通訊分析方法簡介及實(shí)操。遼寧10x空間轉(zhuǎn)錄組

中國銷售產(chǎn)業(yè)憑借獨(dú)特資源和市場優(yōu)勢,一舉成為資本角逐的重點(diǎn)領(lǐng)域之一。從世界范圍來看,美、歐、日等發(fā)達(dá)地區(qū)的銷售產(chǎn)業(yè)發(fā)展歷史悠久,無論是銷售產(chǎn)品制造業(yè)還是銷售服務(wù)業(yè),都處于全球優(yōu)先地位。如行家預(yù)判,服務(wù)型發(fā)展即將步入黃金時(shí)代,眾多企業(yè)圍繞醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)、商業(yè)領(lǐng)域及新興的互聯(lián)網(wǎng)醫(yī)藥等領(lǐng)域正在進(jìn)行廝殺。在我國政策的支持下,在社會資本的推動下以及技術(shù)升級的帶動下,互聯(lián)網(wǎng)巨頭、科技巨頭、地產(chǎn)巨頭等企業(yè)紛紛跨界進(jìn)入服務(wù)型。醫(yī)藥健康方面人才培養(yǎng)體制貧乏,經(jīng)調(diào)查,中國的大學(xué)中把物流管理與醫(yī)藥知識結(jié)合的專業(yè)少之又少,單方面精通的人才對于醫(yī)藥冷鏈物流無法完全勝任,通過調(diào)研冷鏈物流企業(yè),了解到培養(yǎng)物流人員有關(guān)冷鏈物流的相關(guān)知識來勝任冷鏈物流工作的計(jì)劃進(jìn)展緩慢,使得人才成為完善醫(yī)藥健康的重要制約因素。我國經(jīng)濟(jì)進(jìn)入“新常態(tài)”,總體上推動科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢從粗放式增長向注重質(zhì)量、效率方向轉(zhuǎn)變。民間資本的進(jìn)入也一定程度刺激我國科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢市場活力。社會對健康類產(chǎn)業(yè)的關(guān)注度越來越高,迫切需要對科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢的規(guī)模和結(jié)構(gòu)進(jìn)行核算。遼寧10x空間轉(zhuǎn)錄組

上海歐易生物醫(yī)學(xué)科技有限公司總部位于聯(lián)航路1188號25幢,是一家檢驗(yàn)檢測服務(wù)。(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動,具體經(jīng)營項(xiàng)目以相關(guān)部門批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:生物醫(yī)藥產(chǎn)品、生化產(chǎn)品的研發(fā),醫(yī)藥中間體、化工原料及產(chǎn)品(除危險(xiǎn)品化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、易制毒化學(xué)品)的研發(fā)、銷售,儀器儀表的銷售,并提供相關(guān)技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù),會務(wù)服務(wù),企業(yè)管理咨詢。的公司。歐易生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供科研服務(wù),科研檢測,學(xué)術(shù)研究,技術(shù)咨詢。歐易生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長,又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。歐易生物始終關(guān)注醫(yī)藥健康市場,以敏銳的市場洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長共贏。